鱼类荧光标记利用不同颜色的材料注入到动物体表部位来区分不同个体，对动物体伤害非常小，且标记时间长。可标记物种包括鱼类、两栖类、软体动物、 哺乳类等。可以应用于区分个体或者种群、放流标记、选育育种、渔业资源调查评估、洄游习性研究、个体生长研究等。
这种标记是用荧光染料与催化剂混合后，在6-10小时内将标记经过注入鱼体皮下或其他易识别不容易扩散的位置（肌肉生长容易影响染料的观测效果，结缔组织、皮下、额部、颊部、顺着鳍条或尾鳍部为好，但根据不同的鱼体相应选择），根据鱼体的颜色选择相应色差较大的颜色来标记，也可以用颜色的组合排列来区别个体。
主要特点
- 标记成本低廉,标记时间长
- 操作简单，无需培训
- 无需特殊监测仪器
- 对生物体伤害、影响小
- 有多种颜色可选，多种规格可选
- 可选配半自动标记系统
